역사적, 사회적, 종교적 요인이 복합적으로 작용했습니다.

16세기 스페인 식민지배 이후, 가톨릭이 필리핀의 주류 종교가 되었으나, 민다나오 지역은 오랫동안 이슬람 세력이 중심을 이루며 독자적 문화를 유지했습니다. 이후 미국 식민지 시대와 필리핀 독립 후에도 이슬람계 소수민족(모로족 등)은 정치적 소외와 경제적 차별을 겪었습니다.

필리핀 정부는 민다나오 지역에 타지역(주로 기독교인) 이주를 장려해, 원주민 무슬림의 상대적 인구 비율이 급감했습니다. 이로 인해 무슬림들은 사회적·경제적 박탈감을 느끼게 되었고, 이는 저항과 갈등의 원인이 되었습니다.

가톨릭 다수와 이슬람 소수 간의 종교적 긴장과 차별이 심화되면서, 민다나오에서는 1970년대부터 본격적인 무장투쟁(모로민족해방전선, 모로이슬람해방전선 등)이 벌어졌습니다